新疆师范大学沙漠藻研究院成立于2016年12月8日，为新疆师范大学内设科研机构，与新疆中平沙漠藻生物科技有限公司有战略合作，共同打造以科研为主的研究平台。研究院专门从事沙漠藻的风沙治理和干旱、半干旱环境改善及国土整治研究，下设沙漠藻生物及应用研究中心、沙漠藻药物研发中心、沙漠藻生物工程研究中心，并在国内不同类型沙漠化地区建立试验站。
沙漠藻研究院以服务国家“丝绸之路经济带”和西部大开发战略为着眼点，干旱区特殊的沙漠藻为主攻方向，瞄准国际地球科学发展前沿，在全球变化、区域气候与环境演变、生态系统退化机制与重建、沙漠藻重要资源的形成与利用等领域建立国际先进水平理论体系，取得一批具有自主知识产权的创新科技成果。具有一批沙漠藻学科带头人及创新研究团队，充足的科研经费及科研激励机制，与国际、国内多家顶尖科研平台建立合作关系。
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