西双版纳雨林制药有限责任公司的前身为中国科学院西双版纳热带植物园制药厂，始建于1989年4月，位于风景优美的级中国科学院西双版纳热带植物园内。
上世纪七十年代，根据国家有关部委关于发展南药的指示，中国科学院西双版纳热带植物园发现了龙血树资源，研制出替代进口血竭的“国产血竭”（现更名为龙血竭），并于八十年代建立制药厂，专门生产销售龙血竭相关产品。
2001年，为了适应医药行业发展和提高龙血竭产品的技术，中国科学院西双版纳热带植物园对药厂进行改制，并更名为西双版纳雨林制药有限责任公司。
改制以后，公司于2003年通过了GMP认证。2004年公司与植物园共同建设龙血树专类园共和龙血树繁育基地，2005年公司团支部被共青团云南省委授予“青年文明号”，2009年公司被认定为高新技术企业， 2012年公司被国家民委认定为民族特色产品生产企业，2015年公司通过新版GMP认证。
2017年公司在西双版纳景洪工业园区建设新厂区，建筑面积15000平米，建设中药饮片加工、中药提取、片剂、胶囊剂、丸剂等生产线，总投资13000万元，目前土建工程基本完成，计划2019年年底正式投产。新厂区投产后预计销售规模将超亿元，利税2000万元。
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